線粒體、溶酶體、外泌體的提取均屬于亞細胞結構或胞外囊泡的分離純化技術,因各自的結構特性、存在環境差異,提取過程中需重點控制純度、完整性及活性(或功能性),以下是三類物質提取的核心注意事項:
線粒體提取注意事項
線粒體是胞內雙層膜細胞器,提取核心是分離線粒體與細胞質、細胞核等成分,同時避免膜結構破裂導致功能喪失。
樣品處理與前期準備
全程低溫操作(0-4℃),抑制線粒體酶活性喪失及結構降解,所有試劑、離心管、研磨器材需提前冰上預冷。
樣品需新鮮:細胞或組織樣品采集后立即處理,避免常溫放置;組織樣品需在液氮中快速研磨成粉末,加入預冷的線粒體分離緩沖液(含蔗糖等滲透壓調節劑),防止線粒體因滲透壓失衡破裂。
加入保護劑:在緩沖液中添加蛋白酶抑制劑(避免線粒體蛋白降解)和抗氧化劑(如谷胱甘肽,減少活性氧對線粒體的損傷)。
分離與純化過程
控制破碎強度:細胞破碎需采用溫和方式(如玻璃勻漿器手動勻漿、低功率超聲),避免過度破碎導致細胞核、溶酶體破裂污染,同時確保線粒體完整釋放。破碎后可通過光學顯微鏡觀察,確保大部分細胞破碎且線粒體形態正常。
梯度離心參數精準:線粒體分離常用差速離心法,需嚴格控制離心轉速和時間(如先低速離心去除細胞碎片和細胞核,再高速離心收集線粒體沉淀),后續可通過密度梯度離心(如蔗糖梯度、 Percoll 梯度)進一步純化,去除細胞質蛋白和其他細胞器污染。
避免反復凍融:收集的線粒體沉淀需用預冷的保存緩沖液重懸,短期 4℃保存(不超過 24 小時),長期需分裝后 - 80℃凍存,禁止反復凍融破壞膜結構。
純度與活性驗證
純度檢測:通過 Western Blot 檢測標志物,線粒體陽性標志物(如細胞色素 c 氧化酶 IV、線粒體熱休克蛋白 60),陰性標志物(如核蛋白標志物組蛋白 H3、細胞質蛋白標志物 GAPDH),確保無明顯交叉污染。
活性驗證:若需后續功能實驗,需檢測線粒體呼吸鏈酶活性或膜電位,確認提取的線粒體保持生物學活性。
溶酶體提取注意事項
溶酶體是含酸性水解酶的單層膜細胞器,提取關鍵是維持其酸性環境和膜穩定性,避免水解酶釋放導致自身降解及樣品污染。
樣品與試劑準備
緩沖液選擇:使用含酸性調節劑(如檸檬酸 - 磷酸緩沖液,pH 4.5-5.5)和滲透壓穩定劑(如甘露醇、蔗糖)的專用緩沖液,模擬溶酶體內酸性環境,防止膜破裂。
抑制劑添加:除蛋白酶抑制劑外,需加入溶酶體酶抑制劑(如氟化鈉、焦磷酸鈉),抑制溶酶體內部水解酶活性,避免其釋放后降解其他蛋白或自身結構。
樣品新鮮度:細胞或組織需即時處理,溶酶體對溫度敏感,常溫下易破裂,全程嚴格低溫操作。
分離純化關鍵步驟
溫和破碎細胞:采用手動勻漿或低強度超聲破碎,避免高壓導致溶酶體膜破裂,破碎后盡快離心分離,減少水解酶暴露時間。
優化離心方案:通過差速離心初步分離后,采用密度梯度離心(如蔗糖梯度離心,濃度梯度 15%-40%)純化,溶酶體因密度較高會處于特定梯度層,需精準收集目標層。
避免 pH 波動:所有操作中避免緩沖液與堿性溶液接觸,防止 pH 升高破壞溶酶體膜穩定性,收集的溶酶體沉淀需用酸性保存緩沖液重懸。
質量驗證與保存
純度檢測:檢測溶酶體標志物(如酸性磷酸酶、組織蛋白酶 D),排除線粒體、細胞核等雜質污染。
保存條件:短期 4℃保存不超過 12 小時,長期需分裝后 - 80℃凍存,且需加入足量酶抑制劑,解凍后盡快使用。
外泌體提取注意事項
外泌體是細胞分泌的納米級胞外囊泡(直徑 30-150nm),提取核心是提高回收率,同時去除蛋白 aggregates、脂蛋白等雜質。
樣品預處理
樣品選擇:常用細胞培養液、血清、血漿、尿液等,血清 / 血漿樣品需先去除凝血因子和細胞碎片(5000g 離心 10 分鐘),避免干擾后續分離。
避免污染:所有器材需滅菌處理,細胞培養液需使用無外泌體血清(通過超速離心預處理去除血清中的外泌體),防止外源囊泡污染。
提取方法與操作細節
方法適配:根據樣品類型選擇試劑盒(如聚合物沉淀法、超速離心法、免疫親和法),聚合物沉淀法操作簡便但純度較低,超速離心法純度高但對設備要求高,免疫親和法特異性強但產量較低。
超速離心參數:若采用超速離心法,需嚴格控制轉速和時間(如先 10000g 離心 30 分鐘去除大顆粒雜質,再 100000-120000g 離心 70-90 分鐘收集外泌體沉淀),離心過程中保持溫度 4℃,避免囊泡結構破壞。
避免反復離心:多次高轉速離心可能導致外泌體破裂,沉淀重懸時需用預冷的 PBS 緩慢吹打,避免劇烈振蕩。
純度驗證與保存
純度檢測:通過透射電鏡觀察外泌體典型杯狀結構,納米顆粒追蹤分析(NTA)檢測粒徑分布,Western Blot 檢測外泌體標志物(如 CD63、CD81、TSG101)。
保存條件:短期 4℃保存不超過 3 天,長期需分裝后 - 80℃凍存,加入蛋白酶抑制劑,避免反復凍融導致囊泡破裂和蛋白降解。